Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Usp19Q3UJD6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Usp19Q3UJD6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp19Q3UJD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Usp19Q3UJD6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp19Q3UJD6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Usp19Q3UJD6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp19Q3UJD6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Usp19Q3UJD6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Usp19Q3UJD6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms