Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Babam1Q3UI43 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Babam1Q3UI43 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Babam1Q3UI43 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Babam1Q3UI43 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Babam1Q3UI43 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Babam1Q3UI43 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Babam1Q3UI43 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Babam1Q3UI43 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Babam1Q3UI43 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Babam1Q3UI43 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Babam1Q3UI43 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms