Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms