Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam35aQ3UEN2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam35aQ3UEN2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam35aQ3UEN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam35aQ3UEN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam35aQ3UEN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam35aQ3UEN2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam35aQ3UEN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms