Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rnf180Q3U827 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnf180Q3U827 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnf180Q3U827 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rnf180Q3U827 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rnf180Q3U827 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rnf180Q3U827 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rnf180Q3U827 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rnf180Q3U827 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf180Q3U827 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf180Q3U827 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf180Q3U827 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf180Q3U827 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf180Q3U827 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rnf180Q3U827 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rnf180Q3U827 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rnf180Q3U827 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf180Q3U827 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf180Q3U827 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf180Q3U827 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf180Q3U827 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf180Q3U827 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf180Q3U827 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf180Q3U827 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf180Q3U827 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnf180Q3U827 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
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Rnf180Q3U827 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
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Rnf180Q3U827 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf180Q3U827 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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Rnf180Q3U827 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
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Rnf180Q3U827 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
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Rnf180Q3U827 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
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Rnf180Q3U827 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rnf180Q3U827 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf180Q3U827 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rnf180Q3U827 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rnf180Q3U827 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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