Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc174Q3U155 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc174Q3U155 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc174Q3U155 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc174Q3U155 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc174Q3U155 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc174Q3U155 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc174Q3U155 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc174Q3U155 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc174Q3U155 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc174Q3U155 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc174Q3U155 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc174Q3U155 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc174Q3U155 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc174Q3U155 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms