Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrn4clQ3TYX2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrn4clQ3TYX2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrn4clQ3TYX2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms