Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccbe1Q3MI99 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccbe1Q3MI99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccbe1Q3MI99 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccbe1Q3MI99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccbe1Q3MI99 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms