Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rspo3Q2TJ95 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rspo3Q2TJ95 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rspo3Q2TJ95 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rspo3Q2TJ95 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rspo3Q2TJ95 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms