Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 EMC3YKL207W 762 nt6.31□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 TRP2YER090W 1524 nt6.3□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 PAR32YDL173W 888 nt6.3□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 RAD51YER095W 1203 nt6.3□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.3□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 NAS2YIL007C 663 nt6.3□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 STP3YLR375W 1032 nt6.3□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 ALD5YER073W 1563 nt6.3□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 THI6YPL214C 1623 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 TPN1YGL186C 1740 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 ESS1YJR017C 513 nt6.29□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 YIL177CYIL177C 5277 nt6.28□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 FET5YFL041W 1869 nt6.28□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 IGD1YFR017C 588 nt6.28□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 RSM7YJR113C 744 nt6.28□□□□□ -1.4
CCW12Q12127 YJL009WYJL009W 327 nt6.27□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 MIM1YOL026C 342 nt6.27□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 LYS20YDL182W 1287 nt6.26□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 MOB1YIL106W 945 nt6.26□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 PGC1YPL206C 966 nt6.26□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 AAC3YBR085W 924 nt6.26□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 SDS24YBR214W 1584 nt6.26□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 ENO1YGR254W 1314 nt6.25□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 TMS1YDR105C 1422 nt6.25□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 VBA3YCL069W 1377 nt6.24□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 ADH3YMR083W 1128 nt6.24□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 HXT11YOL156W 1704 nt6.24□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 snR86snR86 1004 nt6.23□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 MEX67YPL169C 1800 nt6.22□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 PHB2YGR231C 933 nt6.22□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 YJR149WYJR149W 1215 nt6.22□□□□□ -1.41
CCW12Q12127 YIR035CYIR035C 765 nt6.21□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 CDD1YLR245C 429 nt6.21□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 ORT1YOR130C 879 nt6.21□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 HBS1YKR084C 1836 nt6.2□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 YMR210WYMR210W 1350 nt6.2□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 YLR460CYLR460C 1131 nt6.2□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 BUB2YMR055C 921 nt6.2□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 YBR232CYBR232C 360 nt6.19□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 YFR020WYFR020W 699 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 FLX1YIL134W 936 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 CYC3YAL039C 810 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 IPL1YPL209C 1104 nt6.18□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 FRE6YLL051C 2139 nt6.17□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 SRM1YGL097W 1449 nt6.17□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 URA8YJR103W 1737 nt6.17□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 LEA1YPL213W 717 nt6.17□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 YLR280CYLR280C 351 nt6.16□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 MEP1YGR121C 1479 nt6.15□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 YCR025CYCR025C 411 nt6.15□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 HIS3YOR202W 663 nt6.15□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 OLA1YBR025C 1185 nt6.15□□□□□ -1.42
CCW12Q12127 YBR056WYBR056W 1506 nt6.15□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 YLR072WYLR072W 2082 nt6.14□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 CHS7YHR142W 951 nt6.14□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 snR4snR4 186 nt6.14□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 ILV2YMR108W 2064 nt6.14□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 SRP102YKL154W 735 nt6.13□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 FTH1YBR207W 1398 nt6.13□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 GTB1YDR221W 2109 nt6.13□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 NDE2YDL085W 1638 nt6.12□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 SEN2YLR105C 1134 nt6.12□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 ESBP6YNL125C 2022 nt6.12□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 DUR3YHL016C 2208 nt6.11□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 INO1YJL153C 1602 nt6.11□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 ERO1YML130C 1692 nt6.1□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 ABP1YCR088W 1779 nt6.1□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 RFC1YOR217W 2586 nt6.09□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 YNL140CYNL140C 570 nt6.09□□□□□ -1.43
CCW12Q12127 TIF3YPR163C 1311 nt6.08□□□□□ -1.44
CCW12Q12127 YJL064WYJL064W 396 nt6.08□□□□□ -1.44
CCW12Q12127 DIA4YHR011W 1341 nt6.07□□□□□ -1.44
CCW12Q12127 BUD31YCR063W 474 nt6.07□□□□□ -1.44
CCW12Q12127 YGR137WYGR137W 375 nt6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.5 ms