Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VgfQ0VGU4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VgfQ0VGU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VgfQ0VGU4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VgfQ0VGU4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VgfQ0VGU4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VgfQ0VGU4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VgfQ0VGU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VgfQ0VGU4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
VgfQ0VGU4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VgfQ0VGU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VgfQ0VGU4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VgfQ0VGU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VgfQ0VGU4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VgfQ0VGU4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VgfQ0VGU4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VgfQ0VGU4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VgfQ0VGU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
VgfQ0VGU4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms