Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20,13■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20,08■□□□□ 0,81
Ccl7Q03366 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Ccl7Q03366 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19,97■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ccl7Q03366 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ccl7Q03366 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ccl7Q03366 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45,8 ms