Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Snai1Q02085 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snai1Q02085 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snai1Q02085 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Snai1Q02085 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Snai1Q02085 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Snai1Q02085 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snai1Q02085 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snai1Q02085 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Snai1Q02085 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snai1Q02085 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snai1Q02085 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snai1Q02085 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Snai1Q02085 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Snai1Q02085 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Snai1Q02085 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms