Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 HEM13YDR044W 987 nt10.53□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 PIC2YER053C 903 nt10.53□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 ZRT3YKL175W 1512 nt10.53□□□□□ -0.72
HPC2Q01448 YGL118CYGL118C 438 nt10.52□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 YGR210CYGR210C 1236 nt10.52□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 FMS1YMR020W 1527 nt10.52□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.51□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.51□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.51□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.51□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.51□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 YDR455CYDR455C 309 nt10.51□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 DIG1YPL049C 1359 nt10.51□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 CYT2YKL087C 675 nt10.5□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 EMC3YKL207W 762 nt10.5□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 PBP1YGR178C 2169 nt10.5□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 TAT2YOL020W 1779 nt10.49□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 YBL081WYBL081W 1107 nt10.48□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 NAT5YOR253W 531 nt10.48□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 FCY1YPR062W 477 nt10.48□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 ICE2YIL090W 1476 nt10.48□□□□□ -0.73
HPC2Q01448 ERO1YML130C 1692 nt10.46□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 ERG13YML126C 1476 nt10.45□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 OPI3YJR073C 621 nt10.45□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 Q0144Q0144 330 nt10.44□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 YJL160CYJL160C 864 nt10.44□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 YKR012CYKR012C 378 nt10.44□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.44□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.44□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.44□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.44□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 TPC1YGR096W 945 nt10.43□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 YPL108WYPL108W 507 nt10.43□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 SIR2YDL042C 1689 nt10.43□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 ENO2YHR174W 1314 nt10.42□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 URE2YNL229C 1065 nt10.42□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 SPP2YOR148C 558 nt10.42□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 AMF1YOR378W 1548 nt10.42□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 MLS1YNL117W 1665 nt10.41□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 ENO1YGR254W 1314 nt10.41□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 SDS24YBR214W 1584 nt10.41□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 YLR280CYLR280C 351 nt10.41□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 KAE1YKR038C 1161 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 MOD5YOR274W 1287 nt10.4□□□□□ -0.74
HPC2Q01448 LEU2YCL018W 1095 nt10.39□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 LSB6YJL100W 1824 nt10.39□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YMR210WYMR210W 1350 nt10.39□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 AIM41YOR215C 558 nt10.38□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 RIM2YBR192W 1134 nt10.38□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 GDH1YOR375C 1365 nt10.38□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YCR049CYCR049C 447 nt10.37□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YEL074WYEL074W 339 nt10.37□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 PRE5YMR314W 705 nt10.37□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YPL247CYPL247C 1572 nt10.37□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 BAP3YDR046C 1815 nt10.36□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YDR509WYDR509W 348 nt10.36□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 SDH8YBR269C 417 nt10.36□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 CBK1YNL161W 2271 nt10.36□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YHP1YDR451C 1062 nt10.35□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 MRS3YJL133W 945 nt10.35□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 OCA1YNL099C 717 nt10.35□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 NPL6YMR091C 1308 nt10.34□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 GET2YER083C 858 nt10.34□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YJL067WYJL067W 351 nt10.34□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 ACH1YBL015W 1581 nt10.34□□□□□ -0.75
HPC2Q01448 YPL277CYPL277C 1464 nt10.32□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 VBA3YCL069W 1377 nt10.32□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 CMP2YML057W 1815 nt10.31□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 BNA3YJL060W 1335 nt10.31□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 NAM8YHR086W 1572 nt10.3□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 VPS62YGR141W 1404 nt10.29□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 CWC15YDR163W 528 nt10.28□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 ADA2YDR448W 1305 nt10.28□□□□□ -0.76
HPC2Q01448 YCR099CYCR099C 468 nt10.27□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 SAC7YDR389W 1965 nt10.26□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 TAD2YJL035C 753 nt10.26□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 RRP1YDR087C 837 nt10.25□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 CWC25YNL245C 540 nt10.25□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 COA2YPL189C-A 207 nt10.25□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 ALG7YBR243C 1347 nt10.25□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 MMS21YEL019C 804 nt10.24□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 YPR150WYPR150W 522 nt10.24□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 YAT1YAR035W 2064 nt10.23□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 LSM12YHR121W 564 nt10.23□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 YNR064CYNR064C 873 nt10.23□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 PCL10YGL134W 1302 nt10.23□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 YDL086WYDL086W 822 nt10.22□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 REX2YLR059C 810 nt10.21□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 YLR460CYLR460C 1131 nt10.21□□□□□ -0.77
HPC2Q01448 HDA1YNL021W 2121 nt10.19□□□□□ -0.78
HPC2Q01448 GAT1YFL021W 1533 nt10.19□□□□□ -0.78
HPC2Q01448 YHR145CYHR145C 357 nt10.19□□□□□ -0.78
HPC2Q01448 YNL234WYNL234W 1281 nt10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.7 ms