Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrcdQ00LT2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrcdQ00LT2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PrcdQ00LT2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrcdQ00LT2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms