Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scn1bP97952 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1bP97952 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn1bP97952 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn1bP97952 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn1bP97952 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn1bP97952 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms