Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smn1P97801 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smn1P97801 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smn1P97801 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smn1P97801 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smn1P97801 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smn1P97801 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smn1P97801 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smn1P97801 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smn1P97801 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smn1P97801 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smn1P97801 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smn1P97801 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smn1P97801 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smn1P97801 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smn1P97801 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms