Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubg1P83887 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tubg1P83887 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubg1P83887 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubg1P83887 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubg1P83887 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms