Protein–RNA interactions for Protein: P70371

Terf1, Telomeric repeat-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Terf1P70371 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Terf1P70371 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Terf1P70371 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Terf1P70371 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Terf1P70371 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Terf1P70371 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Terf1P70371 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Terf1P70371 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Terf1P70371 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Terf1P70371 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Terf1P70371 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Terf1P70371 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Terf1P70371 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Terf1P70371 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Terf1P70371 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Terf1P70371 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Terf1P70371 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Terf1P70371 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Terf1P70371 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms