Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfi1P70338 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfi1P70338 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gfi1P70338 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gfi1P70338 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfi1P70338 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms