Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vamp7P70280 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vamp7P70280 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp7P70280 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vamp7P70280 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vamp7P70280 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp7P70280 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp7P70280 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms