Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtnP63089 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtnP63089 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtnP63089 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtnP63089 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtnP63089 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtnP63089 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtnP63089 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtnP63089 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtnP63089 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtnP63089 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtnP63089 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtnP63089 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtnP63089 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtnP63089 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtnP63089 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtnP63089 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtnP63089 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtnP63089 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtnP63089 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtnP63089 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtnP63089 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtnP63089 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtnP63089 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtnP63089 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtnP63089 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtnP63089 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtnP63089 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtnP63089 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtnP63089 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtnP63089 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtnP63089 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtnP63089 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtnP63089 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtnP63089 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtnP63089 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtnP63089 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtnP63089 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtnP63089 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtnP63089 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtnP63089 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtnP63089 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtnP63089 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtnP63089 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtnP63089 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtnP63089 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtnP63089 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtnP63089 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtnP63089 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtnP63089 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtnP63089 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtnP63089 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtnP63089 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtnP63089 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtnP63089 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtnP63089 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtnP63089 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtnP63089 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtnP63089 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtnP63089 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtnP63089 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtnP63089 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtnP63089 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtnP63089 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtnP63089 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtnP63089 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtnP63089 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtnP63089 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtnP63089 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtnP63089 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtnP63089 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtnP63089 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtnP63089 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtnP63089 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtnP63089 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtnP63089 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtnP63089 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtnP63089 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtnP63089 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtnP63089 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtnP63089 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtnP63089 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtnP63089 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtnP63089 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtnP63089 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtnP63089 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms