Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cplx1P63040 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cplx1P63040 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cplx1P63040 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cplx1P63040 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cplx1P63040 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cplx1P63040 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cplx1P63040 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cplx1P63040 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cplx1P63040 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cplx1P63040 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cplx1P63040 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms