Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vsnl1P62761 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vsnl1P62761 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vsnl1P62761 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vsnl1P62761 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vsnl1P62761 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms