Protein–RNA interactions for Protein: P61294

Rab6b, Ras-related protein Rab-6B, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6bP61294 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab6bP61294 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab6bP61294 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab6bP61294 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab6bP61294 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab6bP61294 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab6bP61294 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms