Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx1bP61264 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx1bP61264 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1bP61264 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1bP61264 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx1bP61264 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx1bP61264 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms