Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdrg1P59048 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdrg1P59048 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdrg1P59048 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdrg1P59048 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdrg1P59048 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdrg1P59048 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms