Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk2P58801 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk2P58801 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk2P58801 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk2P58801 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ripk2P58801 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk2P58801 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ripk2P58801 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ripk2P58801 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms