Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Samsn1P57725 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Samsn1P57725 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Samsn1P57725 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Samsn1P57725 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Samsn1P57725 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Samsn1P57725 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Samsn1P57725 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samsn1P57725 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samsn1P57725 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samsn1P57725 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samsn1P57725 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samsn1P57725 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Samsn1P57725 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Samsn1P57725 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms