Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NcstnP57716 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NcstnP57716 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcstnP57716 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NcstnP57716 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NcstnP57716 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcstnP57716 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NcstnP57716 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NcstnP57716 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NcstnP57716 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NcstnP57716 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NcstnP57716 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NcstnP57716 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NcstnP57716 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NcstnP57716 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NcstnP57716 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NcstnP57716 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NcstnP57716 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NcstnP57716 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NcstnP57716 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NcstnP57716 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms