Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rp1P56716 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rp1P56716 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rp1P56716 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rp1P56716 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rp1P56716 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rp1P56716 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rp1P56716 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rp1P56716 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rp1P56716 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rp1P56716 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rp1P56716 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rp1P56716 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rp1P56716 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rp1P56716 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rp1P56716 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rp1P56716 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rp1P56716 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms