Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CdaP56389 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CdaP56389 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CdaP56389 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CdaP56389 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CdaP56389 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CdaP56389 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CdaP56389 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CdaP56389 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CdaP56389 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CdaP56389 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CdaP56389 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CdaP56389 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CdaP56389 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CdaP56389 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CdaP56389 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CdaP56389 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CdaP56389 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CdaP56389 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CdaP56389 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CdaP56389 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CdaP56389 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CdaP56389 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CdaP56389 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CdaP56389 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CdaP56389 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CdaP56389 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CdaP56389 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CdaP56389 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CdaP56389 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CdaP56389 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CdaP56389 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CdaP56389 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CdaP56389 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CdaP56389 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CdaP56389 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CdaP56389 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CdaP56389 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CdaP56389 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CdaP56389 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CdaP56389 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CdaP56389 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CdaP56389 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CdaP56389 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CdaP56389 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CdaP56389 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CdaP56389 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CdaP56389 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CdaP56389 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CdaP56389 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CdaP56389 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CdaP56389 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CdaP56389 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CdaP56389 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CdaP56389 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CdaP56389 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CdaP56389 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CdaP56389 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CdaP56389 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CdaP56389 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CdaP56389 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CdaP56389 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CdaP56389 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CdaP56389 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CdaP56389 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CdaP56389 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CdaP56389 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CdaP56389 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CdaP56389 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CdaP56389 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CdaP56389 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CdaP56389 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CdaP56389 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CdaP56389 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CdaP56389 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CdaP56389 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CdaP56389 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CdaP56389 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CdaP56389 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CdaP56389 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CdaP56389 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CdaP56389 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CdaP56389 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CdaP56389 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CdaP56389 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CdaP56389 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CdaP56389 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CdaP56389 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CdaP56389 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CdaP56389 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CdaP56389 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CdaP56389 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CdaP56389 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CdaP56389 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CdaP56389 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CdaP56389 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CdaP56389 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CdaP56389 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CdaP56389 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CdaP56389 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms