Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PctpP53808 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PctpP53808 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PctpP53808 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PctpP53808 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PctpP53808 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PctpP53808 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PctpP53808 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PctpP53808 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PctpP53808 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PctpP53808 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PctpP53808 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PctpP53808 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PctpP53808 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PctpP53808 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PctpP53808 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PctpP53808 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PctpP53808 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PctpP53808 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PctpP53808 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PctpP53808 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PctpP53808 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PctpP53808 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PctpP53808 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PctpP53808 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PctpP53808 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PctpP53808 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PctpP53808 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PctpP53808 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PctpP53808 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PctpP53808 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PctpP53808 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PctpP53808 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PctpP53808 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PctpP53808 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PctpP53808 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PctpP53808 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PctpP53808 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PctpP53808 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PctpP53808 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PctpP53808 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PctpP53808 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PctpP53808 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PctpP53808 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PctpP53808 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PctpP53808 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PctpP53808 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PctpP53808 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PctpP53808 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PctpP53808 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PctpP53808 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PctpP53808 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PctpP53808 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PctpP53808 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PctpP53808 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PctpP53808 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PctpP53808 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PctpP53808 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PctpP53808 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PctpP53808 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PctpP53808 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PctpP53808 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PctpP53808 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PctpP53808 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PctpP53808 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PctpP53808 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PctpP53808 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PctpP53808 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PctpP53808 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PctpP53808 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PctpP53808 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PctpP53808 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PctpP53808 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PctpP53808 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PctpP53808 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PctpP53808 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PctpP53808 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PctpP53808 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PctpP53808 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PctpP53808 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PctpP53808 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PctpP53808 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PctpP53808 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PctpP53808 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PctpP53808 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PctpP53808 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PctpP53808 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PctpP53808 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PctpP53808 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PctpP53808 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PctpP53808 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PctpP53808 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PctpP53808 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PctpP53808 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PctpP53808 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PctpP53808 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PctpP53808 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PctpP53808 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PctpP53808 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PctpP53808 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms