Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RorcP51450 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RorcP51450 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RorcP51450 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RorcP51450 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RorcP51450 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RorcP51450 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RorcP51450 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RorcP51450 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RorcP51450 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RorcP51450 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RorcP51450 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RorcP51450 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RorcP51450 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RorcP51450 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RorcP51450 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RorcP51450 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RorcP51450 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RorcP51450 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RorcP51450 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RorcP51450 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RorcP51450 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RorcP51450 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RorcP51450 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RorcP51450 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RorcP51450 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RorcP51450 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RorcP51450 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RorcP51450 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RorcP51450 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RorcP51450 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RorcP51450 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RorcP51450 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RorcP51450 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RorcP51450 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RorcP51450 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RorcP51450 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RorcP51450 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RorcP51450 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RorcP51450 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RorcP51450 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RorcP51450 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RorcP51450 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RorcP51450 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorcP51450 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorcP51450 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorcP51450 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RorcP51450 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RorcP51450 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RorcP51450 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RorcP51450 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RorcP51450 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RorcP51450 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RorcP51450 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RorcP51450 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RorcP51450 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RorcP51450 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorcP51450 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorcP51450 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorcP51450 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RorcP51450 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RorcP51450 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RorcP51450 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RorcP51450 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RorcP51450 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorcP51450 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorcP51450 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RorcP51450 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RorcP51450 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RorcP51450 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RorcP51450 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RorcP51450 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RorcP51450 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RorcP51450 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RorcP51450 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RorcP51450 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RorcP51450 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RorcP51450 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RorcP51450 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RorcP51450 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorcP51450 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RorcP51450 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorcP51450 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorcP51450 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorcP51450 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorcP51450 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RorcP51450 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RorcP51450 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RorcP51450 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RorcP51450 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RorcP51450 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RorcP51450 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RorcP51450 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RorcP51450 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RorcP51450 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RorcP51450 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RorcP51450 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RorcP51450 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RorcP51450 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RorcP51450 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms