Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RoraP51448 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RoraP51448 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RoraP51448 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RoraP51448 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RoraP51448 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RoraP51448 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RoraP51448 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RoraP51448 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RoraP51448 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RoraP51448 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RoraP51448 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RoraP51448 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RoraP51448 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RoraP51448 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RoraP51448 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RoraP51448 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RoraP51448 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RoraP51448 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RoraP51448 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RoraP51448 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RoraP51448 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RoraP51448 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RoraP51448 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RoraP51448 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RoraP51448 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RoraP51448 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RoraP51448 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RoraP51448 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RoraP51448 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RoraP51448 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RoraP51448 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RoraP51448 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RoraP51448 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RoraP51448 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RoraP51448 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RoraP51448 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RoraP51448 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RoraP51448 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RoraP51448 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RoraP51448 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RoraP51448 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RoraP51448 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RoraP51448 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RoraP51448 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RoraP51448 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RoraP51448 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RoraP51448 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RoraP51448 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RoraP51448 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RoraP51448 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RoraP51448 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RoraP51448 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RoraP51448 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RoraP51448 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RoraP51448 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RoraP51448 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RoraP51448 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RoraP51448 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RoraP51448 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RoraP51448 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RoraP51448 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RoraP51448 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RoraP51448 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RoraP51448 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RoraP51448 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RoraP51448 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RoraP51448 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RoraP51448 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RoraP51448 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RoraP51448 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RoraP51448 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RoraP51448 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RoraP51448 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RoraP51448 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RoraP51448 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RoraP51448 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RoraP51448 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RoraP51448 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RoraP51448 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RoraP51448 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RoraP51448 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RoraP51448 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RoraP51448 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RoraP51448 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RoraP51448 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RoraP51448 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RoraP51448 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RoraP51448 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RoraP51448 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RoraP51448 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RoraP51448 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RoraP51448 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RoraP51448 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RoraP51448 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RoraP51448 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RoraP51448 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RoraP51448 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RoraP51448 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RoraP51448 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms