Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hnf4aP49698 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hnf4aP49698 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hnf4aP49698 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hnf4aP49698 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hnf4aP49698 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms