Protein–RNA interactions for Protein: P35922

Fmr1, Synaptic functional regulator FMR1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmr1P35922 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fmr1P35922 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fmr1P35922 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fmr1P35922 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Fmr1P35922 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fmr1P35922 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fmr1P35922 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fmr1P35922 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmr1P35922 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fmr1P35922 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmr1P35922 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fmr1P35922 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmr1P35922 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmr1P35922 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fmr1P35922 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmr1P35922 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmr1P35922 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fmr1P35922 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms