Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdha1P35486 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdha1P35486 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdha1P35486 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdha1P35486 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdha1P35486 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdha1P35486 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms