Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoc3P33622 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoc3P33622 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc3P33622 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc3P33622 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc3P33622 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms