Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola2P33611 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pola2P33611 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pola2P33611 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pola2P33611 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola2P33611 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pola2P33611 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pola2P33611 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pola2P33611 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pola2P33611 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola2P33611 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola2P33611 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola2P33611 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola2P33611 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola2P33611 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola2P33611 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola2P33611 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pola2P33611 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms