Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc5P32043 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc5P32043 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc5P32043 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc5P32043 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc5P32043 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms