Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa10P31310 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa10P31310 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa10P31310 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa10P31310 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa10P31310 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa10P31310 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa10P31310 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms