Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msr1P30204 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msr1P30204 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msr1P30204 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msr1P30204 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msr1P30204 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msr1P30204 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Msr1P30204 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msr1P30204 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msr1P30204 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msr1P30204 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msr1P30204 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msr1P30204 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msr1P30204 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msr1P30204 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msr1P30204 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms