Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atxn10P28658 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atxn10P28658 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atxn10P28658 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn10P28658 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atxn10P28658 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms