Protein–RNA interactions for Protein: P28652

Camk2b, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2bP28652 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2bP28652 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camk2bP28652 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camk2bP28652 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camk2bP28652 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camk2bP28652 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2bP28652 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2bP28652 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2bP28652 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Camk2bP28652 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2bP28652 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2bP28652 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2bP28652 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2bP28652 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2bP28652 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2bP28652 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2bP28652 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2bP28652 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2bP28652 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2bP28652 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2bP28652 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2bP28652 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2bP28652 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2bP28652 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2bP28652 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2bP28652 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2bP28652 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camk2bP28652 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Camk2bP28652 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Camk2bP28652 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Camk2bP28652 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Camk2bP28652 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Camk2bP28652 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Camk2bP28652 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms