Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde6aP27664 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde6aP27664 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde6aP27664 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde6aP27664 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde6aP27664 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde6aP27664 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde6aP27664 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde6aP27664 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pde6aP27664 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pde6aP27664 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pde6aP27664 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pde6aP27664 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms