Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SarsP26638 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SarsP26638 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SarsP26638 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SarsP26638 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SarsP26638 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SarsP26638 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SarsP26638 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SarsP26638 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SarsP26638 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SarsP26638 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SarsP26638 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SarsP26638 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SarsP26638 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SarsP26638 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SarsP26638 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SarsP26638 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SarsP26638 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SarsP26638 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SarsP26638 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SarsP26638 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SarsP26638 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SarsP26638 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SarsP26638 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SarsP26638 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SarsP26638 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SarsP26638 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SarsP26638 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SarsP26638 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SarsP26638 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SarsP26638 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SarsP26638 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SarsP26638 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SarsP26638 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SarsP26638 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SarsP26638 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SarsP26638 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SarsP26638 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SarsP26638 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SarsP26638 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SarsP26638 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SarsP26638 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SarsP26638 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SarsP26638 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SarsP26638 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SarsP26638 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SarsP26638 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SarsP26638 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SarsP26638 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SarsP26638 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SarsP26638 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SarsP26638 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SarsP26638 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SarsP26638 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SarsP26638 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SarsP26638 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SarsP26638 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SarsP26638 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SarsP26638 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SarsP26638 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SarsP26638 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SarsP26638 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SarsP26638 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SarsP26638 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SarsP26638 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SarsP26638 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SarsP26638 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SarsP26638 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SarsP26638 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SarsP26638 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SarsP26638 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SarsP26638 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SarsP26638 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SarsP26638 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SarsP26638 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SarsP26638 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SarsP26638 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SarsP26638 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SarsP26638 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SarsP26638 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SarsP26638 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SarsP26638 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SarsP26638 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SarsP26638 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SarsP26638 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SarsP26638 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SarsP26638 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SarsP26638 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SarsP26638 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SarsP26638 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SarsP26638 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SarsP26638 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SarsP26638 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SarsP26638 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SarsP26638 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SarsP26638 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SarsP26638 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SarsP26638 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SarsP26638 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SarsP26638 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms