Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfraP26618 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PdgfraP26618 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdgfraP26618 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PdgfraP26618 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PdgfraP26618 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfraP26618 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PdgfraP26618 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PdgfraP26618 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms