Protein–RNA interactions for Protein: P23299

Kcne1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcne1P23299 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcne1P23299 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcne1P23299 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcne1P23299 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcne1P23299 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcne1P23299 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms