Protein–RNA interactions for Protein: P22272

Il6ra, Interleukin-6 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6raP22272 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Il6raP22272 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Il6raP22272 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Il6raP22272 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Il6raP22272 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6raP22272 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Il6raP22272 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Il6raP22272 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Il6raP22272 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6raP22272 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6raP22272 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6raP22272 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6raP22272 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6raP22272 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6raP22272 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6raP22272 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6raP22272 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6raP22272 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Il6raP22272 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Il6raP22272 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Il6raP22272 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms