Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fcer1aP20489 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcer1aP20489 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcer1aP20489 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcer1aP20489 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcer1aP20489 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcer1aP20489 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fcer1aP20489 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fcer1aP20489 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fcer1aP20489 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms